就在清廷下旨，对北京百姓进行安抚之后，多尔衮又立刻下令，招洪承畴入见，商议军务。
北京动乱发生之后，洪承畴也奉旨率领本部的新军进入北京，平定这一次动乱，在动乱平息下来之后，多尓衮也没有让洪承畴回去，而是让他将人马就驻扎在北京的西南郊外。一方面是动乱平息之后，还要稳定一段时间来稳定，另一方面多尔衮也要向洪承畴了解一下新军训练的情况。
多尔衮心里十分清楚，这场动乱是南京政府在背后组织、谋划。那么这个消息很快就会传到南京去，而商毅一但收到这个消息，他绝不会错过这个机会的。因此现在也有必要了解一下，新军的训练达到一个怎样的水平，是否可以出战了。而如果中华军向清廷发动进攻，会选择从那里动手，清廷应该怎样布置防御。
现在清廷的兵边布置是：在边境的主要分南阳、徐州、济南三个地区驻守。驻守南阳的是怀顺王耿仲明部，总计兵力为八万余人；驻守徐州的是顺郡王勒克德诨，兵力为十三万左右；驻守济南的是侥余郡王阿巴泰，兵力为十万余众。
另外清廷在西安还布置五万人马，由尼堪率领，一来是驻守西北地区，二来也是防备吴三桂的川中人马。而在天津也驻守了六万人马，以防中华军再从海路进攻，同时还在辽东也驻守了十万人马。而在北京周边地区，驻军约有二十余万。也形成以北京为核心，向外围散放的兵力布置。
而被淸廷寄于厚望的新军现在共有九万三干余人，比当初扩大了二万余人，共分为六个营，俱体的番号和分布为：
神武营：由满八旗组成，共计兵力二万人，配有火枪一万五千支，火炮四百余门，统领是宗室洛托，现在驻守北京周边；
神威营：由满蒙八旗组成，共计一万五千人，配有火枪一万一千支，火炮二百八十余门，统领是阿巴泰的幼子岳乐，现在驻守济南；
神勇营：由满蒙八旗组成，共计一万五千人，配有火枪一万一千支，火炮二百八十余门，统领是代善的孙子巴尔楚浑，现在驻守徐州；
神兵营：由汉军八旗组成，共计一万三千人，配有火枪八千支，火炮二百二十余门，统领是李永芳的三子巴颜，现在驻守南阳；
神工营：由汉军八旗组成，共计一万五千人，配有火枪一万支，火炮二百四十余门，统领是佟图赖，现在驻守北京周边；
神军营：由绿营军组成，共计一万五千人，配有火枪九千支，火炮二百二十门，统领是金维城，现在驻守北京周边；
全部新军一共拥有火枪六万五千余支，火炮一千六百余门，火枪比率为七成五，平均每万人拥有火炮一百七十余门。其中火枪的比率和中华虎贲军相差无几，火炮还要少一些。但像神武营、神威营、神勇营的火炮配置率要高一些，己经接近了万人两百门火炮的比率。
不过这些只是数字上的对比，而实际中，清军使用的火枪仍在六成以上是火绳枪，燧发枪的总数还不足二万支，但每种火枪到是都装配了刺刀。而火炮基本都只能发射实心弹和霰弹，开花弹、拉弦式手榴弹清廷始终还没有制造出来。但和以前相比，清廷的新军确实更接近于一支近代军队了。
看到这些数字,多尔衮也颇有些欣慰,这两年多的时间以来,清廷在新军上确实花耗了大量的心血，现在总算也是有了一些成效了。
在名议上，洪承畴是所有新军的总统领，但在实际上，他只能直接指挥神军营的这一万五千人马，而从中华军那边收降过来的教官营成员，现在也都在神军营里任职，也成为清廷的正式军官。李本深和赵岳都担任参领，其余分别担任千总﹑把总等职。
洪承畴当然也知道，清廷不可能把所有的新军全都交给自己统领，能给自己留下一个营的人马，就己经很不错了。在北京动乱发生之后，洪承畴率兵进京，等动乱暂时平息了下来之后，洪承畴驻军在密云县，维持北京周边地区的治安。对于北京內部对于这次动乱善后的争论，洪承畴心里虽然清楚，应以安抚为主，不可再施行强硬手段，但他同样也清楚，这不是自己应该参与的事情，因此对此也一声不吭。
不过对于逃到密云县的北京百姓，洪承畴还是尽量安抚，并使他们在密云地区安置下来，并给他们提供粮食和住所，差不多等于是建立了一个难民营，到了后来，差不多收容了约有七八万百姓。
等清廷正式下旨，赦免百姓，让百姓重新返回北京之后，洪承畴也立刻将这一批百姓，全部都遣返回北京，并如实向清廷报告了自巳收容难民的事情。
当然在清廷做出安抚百姓的决定之后，洪承畴的这些工作也受到清廷的大加赞扬，密云到北京还不到一天的路程，因此就在第二天，清廷的嘉奖圣旨也发了下来，加封洪承畴为一等阿达哈哈番，并招他入京面对。
洪承畴当然知道，这个时候招自己进京，绝不会是只为嘉奖自己安抚百姓的工作，恐怕也是战事的需要。在动乱发生之后，洪承畴同样也估计到了，中华军一定不好错过这个机会，乘机向清廷发动进攻，因此洪承畴在这段时间里，除了安抚百姓之外，也对目前南北的局势作了一番细仔的研索，做足了准备工作。
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